La influenza aviar cambió de ruta en Chile: de la costa al valle central

Resumen ejecutivo
El virus de influenza aviar H5N1 del clado 2.3.4.4b llegó a Chile a fines de 2022 y desde entonces ha tenido dos olas con un patrón geográfico distinto. La primera, entre diciembre de 2022 y 2023, bajó por la costa desde el norte. Las autoridades registraron más de 62.300 aves silvestres muertas y 14.987 lobos marinos muertos, y en marzo de 2023 se confirmó el único caso humano del país. En aves domésticas hubo 12 planteles comerciales y 164 traspatios afectados, con casi 1,5 millones de aves eliminadas y un impacto estimado de USD 106 millones para la industria. La segunda ola comenzó en marzo de 2026 y avanzó por el interior. Afectó a cisnes y otras aves de humedales de agua dulce, a 45 traspatios y a tres planteles de gallinas de postura en las regiones Metropolitana, del Maule y de La Araucanía. Un estudio genómico chileno había encontrado que las aves de agua dulce tenían la mayor positividad al virus (22,1%), por encima de las costeras. Chile recuperó el estatus de país libre en junio de 2026, en unos 90 días. A juicio de Evidencia Vet, la lección de 2026 es que el riesgo ya no depende solo de las colonias costeras: los humedales del valle central, los traspatios y los planteles de postura forman hoy la interfaz principal. El brote en vacas lecheras de Estados Unidos y la experiencia francesa con vacunación de patos amplían la discusión hacia la lechería y hacia la vacunación.
Detalles adicionales del estudio
| Campo | Detalle |
|---|---|
| Pregunta | ¿Qué cambió entre la ola de influenza aviar H5N1 de 2022 y 2023 y la de 2026 en Chile, y qué implica para la avicultura y la lechería nacional? |
| Datos chilenos | Genómica y epidemiología del brote 2022 y 2023 (Pardo-Roa et al., 2025; Vega-Macaya et al., 2026), informe ODEPA sobre 2023, informe de la Biblioteca del Congreso y comunicados del SAG sobre 2026 |
| Datos internacionales | Brote en vacas lecheras de Estados Unidos (2024 a 2025) y vacunación de patos en Francia (2023 y 2024) |
| Limitaciones | Las cifras de 2026 provienen de informes oficiales y prensa, porque aún no hay estudios revisados por pares sobre esa ola. No hubo acceso a la base de datos completa del SAG |
La primera ola: un virus que bajó por la costa
El virus que llegó a Chile y Perú provino de una sola introducción desde Norteamérica, estimada entre agosto y octubre de 2022. Desde diciembre de ese año se extendió de norte a sur por más de 3.800 km de costa (Pardo-Roa et al., 2025).
Entre diciembre de 2022 y abril de 2023 se analizaron 18.501 muestras de 9.745 casos, y el 7,33% de los casos resultó positivo. Las autoridades registraron más de 62.300 aves silvestres muertas y 17.294 pingüinos y mamíferos marinos muertos, de los cuales 14.987 eran lobos marinos comunes. Entre los mamíferos marinos analizados hubo positivos en lobos marinos, chungungos, marsopas espinosas y delfines chilenos (Pardo-Roa et al., 2025).
Adaptación a mamíferos. Los virus de mamíferos marinos formaron un grupo genético propio con mutaciones compartidas, compatible con transmisión de mamífero a mamífero a lo largo del Pacífico, que luego continuó hacia Argentina, Uruguay y Brasil. La mutación D701N del gen PB2, asociada a adaptación a mamíferos, apareció en el virus del caso humano y en nueve virus de mamíferos marinos (Pardo-Roa et al., 2025).
El caso humano. En marzo de 2023, un hombre de 53 años de Antofagasta presentó neumonía grave y requirió ventilación mecánica. Su virus tenía las mutaciones D701N y Q591K en PB2, probablemente adquiridas durante la infección, y sus contactos cercanos resultaron negativos (CDC, 2023). Sigue siendo el único caso humano confirmado en Chile.
El golpe a la industria. En 2023 se confirmaron 12 focos en planteles comerciales, cerca del 1,5% de los 8.155 planteles industriales del país, y 164 en traspatios. Se eliminaron 1.485.077 aves en planteles comerciales, el 53% de carne y el 47% de postura:
| Región | Tipo de plantel | Aves eliminadas |
|---|---|---|
| Metropolitana | Broiler (1 plantel) | 540.303 |
| O’Higgins | Reproductoras broiler (1 plantel) | 41.378 |
| Valparaíso | Pavos (5 planteles) | 173.203 |
| Maule y Biobío | Postura (5 focos) | 730.193 |
El impacto económico se estimó en 84.997 millones de pesos, unos USD 106 millones, equivalentes al 3,7% del valor bruto de la producción avícola. Como referencia, Chile exportó en 2022 unos USD 700 millones en carne de ave, el 81% hacia Estados Unidos, México y China (Fuentes, 2024).
La segunda ola: humedales, traspatios y gallinas de postura
El 24 de marzo de 2026 el SAG confirmó influenza aviar de alta patogenicidad en un plantel de gallinas de postura de El Monte, Región Metropolitana, con unas 600.000 aves, cerca del 3% de la capacidad de postura del país. Chile autosuspendió de inmediato la certificación de exportaciones avícolas (Diario Financiero, 2026a). En abril se sumó un plantel de postura en Cunco, La Araucanía, con unas 120.000 gallinas, que fueron eliminadas reduciendo el oxígeno del galpón y enterradas en fosas impermeabilizadas dentro del predio (Diario Financiero, 2026b).
Al 6 de abril, el balance oficial sumaba 20 focos (3 en aves silvestres, 15 en traspatios y 2 en planteles comerciales) y 701.662 aves afectadas o eliminadas, el 99,5% de ellas en planteles de la Región Metropolitana (González, 2026). A mayo, la cifra superaba las 700.000 aves domésticas y 739 aves silvestres de ocho especies, con focos en nueve regiones entre Valparaíso y Aysén. En el Lago Budi, La Araucanía, se encontraron 128 cisnes de cuello negro muertos, una especie catalogada en peligro entre Biobío y Los Lagos, y también hubo mortalidad de cisnes en el humedal del río Cruces, en Valdivia (Mongabay, 2026).
En el Maule, el primer hallazgo fue en cisnes coscoroba en San Clemente, seguido por planteles industriales y traspatios. A comienzos de mayo la región sumaba 11 casos en seis comunas y 1.753 aves muertas o eliminadas (Diario El Centro, 2026).
Al cierre de la emergencia se contabilizaban tres planteles comerciales de postura afectados (Metropolitana, Maule y La Araucanía), 45 focos en traspatios y casos en fauna silvestre en todas las regiones salvo Coquimbo. En junio de 2026 Chile cerró el último de esos tres focos y se autodeclaró ante la OMSA libre de influenza aviar de alta patogenicidad en aves de corral, en un plazo de 90 días (aviNews, 2026).
Por qué el interior. El brote de 2022 y 2023 se movió por la costa y se concentró en aves marinas y lobos marinos. El de 2026 comenzó en otoño y avanzó sobre todo por el valle central, a través de humedales y aves de agua dulce (Mongabay, 2026). Un análisis genómico y espacial de la primera ola ya mostraba esa vulnerabilidad: las aves de agua dulce tuvieron la mayor positividad (22,1%), por encima de las costeras (17,6%), y los focos en aves domésticas, que fueron el 34,8% del total, se concentraron en la zona central. La temperatura y la humedad se asociaron positivamente con la positividad en aves silvestres, y la densidad de población humana, negativamente (Vega-Macaya et al., 2026).
Ola 2022 y 2023 frente a ola 2026
| Aspecto | 2022 y 2023 | 2026 |
|---|---|---|
| Ruta principal | Costa, de norte a sur | Valle central y humedales del interior |
| Fauna más afectada | Aves marinas, lobos marinos, pingüinos | Cisnes y otras aves de agua dulce |
| Mamíferos | 14.987 lobos marinos muertos; transmisión entre mamíferos | Sin casos en mamíferos en el balance oficial de abril |
| Planteles comerciales | 12 (carne, reproductoras, pavos y postura) | 3, todos de postura |
| Traspatios | 164 | 45 |
| Aves comerciales eliminadas | 1.485.077 | Más de 800.000 (698.007 en la Región Metropolitana y unas 120.000 en La Araucanía; en el Maule, 1.753 aves entre todos sus focos) |
| Casos humanos | 1 (Antofagasta) | Ninguno |
| Recuperación del estatus libre | Autodeclaración ante la OMSA en septiembre de 2023 | Junio de 2026, unos 90 días después del primer foco comercial |
Fuentes: Pardo-Roa et al. (2025), Fuentes (2024), González (2026), Mongabay (2026), SAG.
Figura 1. Las dos olas de influenza aviar H5N1 en Chile y el contexto internacional. Elaboración propia a partir de las fuentes citadas.
Lo que pasó en las vacas lecheras de Estados Unidos
En marzo de 2024 se confirmó el virus H5N1 en vacas lecheras de Estados Unidos, un hospedero que no se consideraba relevante para la influenza aviar. Hacia fines de 2025 había rebaños afectados en 19 estados, 41 trabajadores de lecherías infectados y 70 casos humanos en total en el país, sin transmisión entre personas. La infección se concentra en la glándula mamaria, con caída brusca de la producción y leche espesa, y el virus se encuentra en la leche cruda, que se desvía o destruye en los rebaños afectados. La pasteurización lo inactiva (AVMA, 2025).
En una de las primeras lecherías afectadas en Texas, entre el 10% y el 15% de las vacas enfermó, con menor consumo de alimento, caída brusca de la producción y leche espesa de color amarillo cremoso, con cargas virales muy altas. El cuadro alcanzó su máximo entre 4 y 6 días después de los primeros casos y cedió en 10 a 14 días, con escasa mortalidad. De los cerca de 24 gatos del predio, más de la mitad enfermó y murió tras consumir leche y calostro crudos de vacas enfermas. Mostraron depresión, marcha rígida, ataxia, ceguera y movimientos en círculo, y la necropsia reveló meningoencefalitis necrotizante y coriorretinitis con antígeno viral en neuronas y retina (Burrough et al., 2024). Hasta comienzos de 2025 todos los casos en bovinos eran del genotipo B3.13; luego se detectó un segundo genotipo, D1.1, en Nevada y Arizona, encontrado gracias al análisis de leche de silos de las plantas procesadoras antes de que las vacas mostraran signos (AVMA, 2025).
La situación en Chile. Nunca se ha detectado influenza aviar en bovinos en el país. En enero de 2025 el SAG convocó una mesa con el Ministerio de Salud, INDAP, ODEPA y los gremios lecheros para coordinar medidas preventivas y protocolos ante un eventual caso positivo (Diario Lechero, 2025). La preocupación es la llegada de aves migratorias del hemisferio norte. En 2026, la mortalidad de cisnes en el río Cruces y el Lago Budi ocurrió en plena zona lechera del sur, lo que a juicio de Evidencia Vet justifica mantener la vigilancia en esa interfaz.
Vacunar o no vacunar
Chile controla la influenza aviar con eliminación de las aves afectadas, zonas de control y zonificación para mantener las exportaciones. En 2026, esa zonificación permitió retomar en una semana los envíos a Estados Unidos, México, Puerto Rico, Canadá y el Reino Unido, mientras China mantuvo su cierre (SAG, 2026).
Francia optó por otro camino. Desde el 1 de octubre de 2023 vacunó a sus patos en producción, con más de 35 millones de aves con dos dosis a julio de 2024. En la temporada 2023 y 2024 tuvo 10 focos en planteles, frente a 396 en la anterior y 1.374 en la de 2021 y 2022. Un modelo estimó que sin vacunación habría tenido 487 focos (IC 95% 314 a 756), lo que equivale a una reducción de entre 96% y 99% en el tamaño de la epizootia. El modelo muestra una asociación sin probar causalidad, hubo focos en lotes vacunados con protección insuficiente y la estrategia puede no funcionar en países con sectores avícolas distintos (Guinat et al., 2025).
La experiencia francesa no se traslada directamente a Chile. Francia vacunó patos, mientras los focos comerciales chilenos de 2026 fueron en gallinas de postura, una especie y un sistema productivo distintos. Además, la vacunación obliga a demostrar a los mercados de destino que el virus no circula en aves vacunadas, lo que exige vigilancia adicional. Con exportaciones de unos USD 700 millones al año, la decisión es tanto comercial como sanitaria. A juicio de Evidencia Vet, el debate merece abrirse para planteles de postura de larga vida, que concentran el riesgo en 2026, más que para la avicultura de carne.
Qué se puede hacer en los planteles
Desde abril de 2023 existe en Chile el Sistema Oficial de Bioseguridad en Establecimientos Pecuarios, creado por la Resolución Exenta 2.114 del SAG, obligatorio para las especies que el servicio determine (González, 2026). La bioseguridad del plantel sigue siendo la principal herramienta:
- Separar aves domésticas y silvestres. Mallas en galpones, control de fuentes de agua abiertas y retiro de alimento derramado que atraiga aves.
- Vigilar el entorno. Los traspatios vecinos y los humedales cercanos fueron la puerta de entrada en 2026.
- Controlar personas, vehículos y equipos. Cambio de ropa y calzado, desinfección de vehículos y restricción de visitas en temporada de riesgo.
- Notificar rápido. Mortalidad brusca, caída de postura, huevos deformes o signos respiratorios deben informarse al SAG de inmediato.
Interpretación Evidencia Vet
La influenza aviar H5N1 dejó de ser en Chile un problema de colonias costeras. La primera ola se movió por el mar y golpeó a lobos marinos y aves marinas; la segunda entró por humedales del interior y llegó a planteles de postura del valle central. Los datos genómicos de la primera ola ya mostraban que las aves de agua dulce eran las más positivas, y 2026 lo confirmó en terreno.
El sistema de respuesta funcionó: Chile retomó exportaciones a sus principales mercados en una semana y recuperó el estatus libre en unos 90 días. La amenaza, sin embargo, es estacional y regional. Mientras el virus circule en aves silvestres de Sudamérica, la industria debe asumir que volverá; la duda es cuándo y por dónde.
Tres frentes merecen atención. Los planteles de postura, que fueron los únicos comerciales afectados en 2026 y donde el debate sobre vacunación tiene más sentido. Los traspatios, que suman la mayor cantidad de focos y conectan aves silvestres con domésticas. Y la lechería del sur, que comparte territorio con los humedales donde murieron los cisnes y que, con la experiencia de Estados Unidos, conviene vigilar antes de que aparezca un caso.
¿Qué significa esto en terreno?
- Revisar la bioseguridad antes del otoño, cuando comenzó la ola de 2026, con foco en el acceso de aves silvestres a galpones y agua.
- Mapear los humedales y traspatios cercanos a cada plantel como parte del análisis de riesgo.
- Notificar al SAG ante mortalidad brusca o caída de postura, sin esperar diagnóstico.
- En lecherías, vigilar caídas bruscas de producción con leche espesa, evitar el consumo de leche cruda por personas, perros y gatos, y notificar cualquier sospecha.
- Proteger a los trabajadores que manejan aves enfermas o muertas con equipo de protección personal.
Conclusión
La influenza aviar H5N1 llegó a Chile para quedarse como amenaza estacional. La ola de 2026 mostró que el virus puede entrar por el interior y golpear a la avicultura de postura del valle central, y el brote en vacas lecheras de Estados Unidos mostró que puede saltar a especies que no se consideraban en riesgo. La respuesta chilena fue rápida, pero la prevención depende de la bioseguridad en cada plantel, de la vigilancia en traspatios y humedales y de abrir, con datos, la discusión sobre vacunación en postura.
Puntos clave
- La ola de 2022 y 2023 bajó por la costa y mató a 14.987 lobos marinos; la de 2026 avanzó por humedales y valle central.
- En 2023 hubo 12 planteles comerciales afectados y casi 1,5 millones de aves eliminadas, con un impacto de unos USD 106 millones.
- En 2026, los tres planteles comerciales afectados fueron de postura, en las regiones Metropolitana, del Maule y de La Araucanía.
- Las aves de agua dulce tuvieron la mayor positividad al virus en Chile (22,1%), por encima de las costeras (17,6%).
- Chile recuperó el estatus libre en junio de 2026, unos 90 días después del primer foco comercial.
- Chile nunca ha detectado influenza aviar en bovinos; en Estados Unidos hubo rebaños lecheros afectados en 19 estados.
- La vacunación de patos en Francia se asoció a una reducción de entre 96% y 99% de los focos según un modelo; su aplicación en Chile depende de la especie y del impacto comercial.
Preguntas frecuentes
¿Es seguro consumir carne de ave y huevos? Sí, si están bien cocidos. Durante el brote de 2026 la autoridad recomendó evitar huevos crudos y mayonesa casera.
¿Hay riesgo para las personas? Chile tuvo un solo caso humano, en 2023, sin contagio a otras personas. El riesgo es mayor para quienes manipulan aves o animales enfermos o muertos sin protección.
¿Puede llegar el virus a las vacas lecheras chilenas? No se ha detectado en bovinos en Chile. En Estados Unidos se transmitió entre rebaños lecheros desde 2024, y el SAG mantiene una mesa de coordinación con el sector lechero desde 2025.
¿Por qué Chile no vacuna a sus aves? Porque la estrategia se basa en eliminación de focos y zonificación, que permite mantener exportaciones. La vacunación exige vigilancia adicional para demostrar a los mercados que el virus no circula en aves vacunadas.
Declaración del autor
El autor se desempeña en la industria salmonicultora y no tiene vínculos con empresas avícolas, lecheras ni con fabricantes de vacunas. Este artículo corresponde a un análisis personal basado en fuentes públicas.
Referencias
Artículos revisados por pares
- Burrough, E. R., Magstadt, D. R., Petersen, B., Timmermans, S. J., Gauger, P. C., Zhang, J., et al. (2024). Highly pathogenic avian influenza A(H5N1) clade 2.3.4.4b virus infection in domestic dairy cattle and cats, United States, 2024. Emerging Infectious Diseases, 30(7), 1335-1343. https://doi.org/10.3201/eid3007.240508
- Guinat, C., Fourtune, L., Lambert, S., Martin, E., Gerbier, G., Jimenez Pellicer, A., Guérin, J.-L., & Vergne, T. (2025). Promising effects of duck vaccination against highly pathogenic avian influenza, France, 2023–2024. Emerging Infectious Diseases, 31(7), 1468-1471. https://doi.org/10.3201/eid3107.241445
- Pardo-Roa, C., Nelson, M. I., Ariyama, N., et al. (2025). Cross-species and mammal-to-mammal transmission of clade 2.3.4.4b highly pathogenic avian influenza A/H5N1 with PB2 adaptations. Nature Communications, 16, 2232. https://doi.org/10.1038/s41467-025-57338-z
- Vega-Macaya, F., Díaz-Gavidia, C., Sánchez-Rodríguez, F., et al. (2026). Transboundary spread and ecological drivers of HPAI H5N1 clade 2.3.4.4b during the 2022–2023 outbreak in Chile: an integrated genomic and spatial epidemiology framework. Transboundary and Emerging Diseases, 2026, 1266281. https://doi.org/10.1155/tbed/1266281
Informes oficiales y otras fuentes
- American Veterinary Medical Association (AVMA). Avian influenza virus type A (H5N1) in U.S. dairy cattle. Actualizado el 16 de diciembre de 2025.
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Human infection with highly pathogenic avian influenza A(H5N1) virus in Chile. Addendum, marzo de 2023.
- aviNews (2026). Chile recupera su estatus de país libre de influenza aviar H5N1 y fortalece su prestigio sanitario internacional. 25 de junio de 2026, con información del SAG.
- Diario El Centro (2026). Refuerza bioseguridad avícola ante influenza aviar en la Región del Maule. 5 de mayo de 2026.
- Diario Financiero (2026a). SAG confirma detección del primer caso positivo de influenza aviar H5N1 en aves de postura en un plantel industrial. 25 de marzo de 2026.
- Diario Financiero (2026b). 120 mil aves ponedoras serán sacrificadas tras detección del primer brote de influenza aviar en un plantel comercial de La Araucanía. 17 de abril de 2026.
- Diario Lechero (2025). SAG coordina acciones con gremios lecheros tras casos de influenza aviar en bovinos en Estados Unidos. 8 de enero de 2025.
- Fuentes, O. (2024). Situación de la influenza aviar en Chile, 2023. Oficina de Estudios y Políticas Agrarias (ODEPA), junio de 2024.
- González, P. (2026). Brote influenza aviar 2026. Antecedentes generales y situación nacional. Asesoría Técnica Parlamentaria, Biblioteca del Congreso Nacional de Chile, abril de 2026.
- Mongabay Latam (2026). Chile: la influenza aviar está afectando más a cisnes de cuello negro y otras aves de agua dulce. 12 de mayo de 2026, con datos del panel público del SAG.
- Organización Mundial de Sanidad Animal (OMSA). Autodeclaración de Chile como país libre de influenza aviar de alta patogenicidad. Septiembre de 2023.
- Servicio Agrícola y Ganadero (SAG) (2026). SAG aclara situación de exportaciones de productos avícolas a la República Popular China tras brote de influenza aviar en plantel comercial. 23 de abril de 2026.
- Servicio Agrícola y Ganadero (SAG). Resolución Exenta 2.114, Sistema Oficial de Bioseguridad en Establecimientos Pecuarios. 7 de abril de 2023.
Cómo citar este resumen
Conejeros, A. (2026). La influenza aviar cambió de ruta en Chile: de la costa al valle central. Evidencia Vet. Recuperado de https://evidenciavet.cl/monogastricos/influenza-aviar-h5n1-chile-costa-valle-central/.
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